RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFI1A8K8P3 1242 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM13AO94988 1023 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHA7Q15375 998 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.6■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR3C1P04150 777 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB5P18084 799 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NACC1Q96RE7 527 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIT2Q99578 217 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.59■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANO9A1A5B4 782 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLR2O60603 784 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP3O75969 853 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APBA1Q02410 837 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GHRHRQ02643 423 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNA1Q09470 495 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGKZQ13574 1117 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.58■□□□□ 0.89
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCRP11274 1271 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYCT1Q8N699 235 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL31RAQ8NI17 732 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LXNQ9BS40 222 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GANQ9H2C0 597 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARVGQ9HBI0 331 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GINM1Q9NU53 330 aa20.58■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPXCR1Q8N123 301 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCND2Q9NZV8 630 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC151A5D8V7 595 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POTEB2H3BUK9 544 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGFB1I1O43294 461 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPING1P05155 500 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALAS1P13196 640 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF131P52739 623 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICALL2Q8IY33 904 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM58Q8NG06 486 aa20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEA1P43355 309 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BANK1Q8NDB2 785 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIZ1Q96SL8 496 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.56■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PJA2O43164 708 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRGAP2O75044 1071 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLOT1O75955 427 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP4P49662 377 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTMR2Q13614 643 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRD3Q15059 726 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEK9Q8TD19 979 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH11P35749 1972 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOCK1Q14185 1865 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIC2O15247 247 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP8B1O43520 1251 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACC1O75410 805 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VCAM1P19320 739 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNKPQ96T60 521 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.55■□□□□ 0.88
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms