RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTN1P12814 892 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEDQ86YR6 584 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 SFNP31947 248 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 JAK3P52333 1124 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM20AQ96MK3 541 aa28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.2■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 KLRC1P26715 233 aa28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 UGCGQ16739 394 aa28.18■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 SZT2Q5T011 3432 aa28.17■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 CAND2O75155 1236 aa28.17■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.17■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF862O60290 1169 aa28.16■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 GJB2P29033 226 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB123Q8N688 67 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 RDM1Q8NG50 284 aa28.16■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.15■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 GPR153Q6NV75 609 aa28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1-202ENST00000425695 BANK1Q8NDB2 785 aa28.15■■■□□ 2.1
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HTATSF1-202ENST00000425695 EVPLQ92817 2033 aa28.14■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC34A2O95436 690 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 RABGGTBP53611 331 aa28.13■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 PBX4Q9BYU1 374 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.13■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 TXKP42681 527 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNJ6P48051 423 aa28.11■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 MCTP1Q6DN14 999 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 METTL13Q8N6R0 699 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT8Q92599 483 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.11■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM150BA6NC51 233 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 C22orf31O95567 290 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR5P61964 334 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 IER5Q5VY09 327 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 MSRAQ9UJ68 235 aa28.1■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.09■■■□□ 2.09
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