RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417895.1

NEK7-204, Transcript of NIMA related kinase 7, human

TSL 3

Gene NEK7, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK7-204	ENST00000417895	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	FGFR1	P11362	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	C6	P13671	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	FAH	P16930	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TUSC3	Q13454	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	DDR2	Q16832	855 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895		Q6ZUG5	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PTPN18	Q99952	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CEP170	Q5SW79	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	LAMC1	P11047	1609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF623	O75123	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	FBXO21	O94952	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GNAT1	P11488	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TCF3	P15923	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GRK2	P25098	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GRK3	P35626	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GDF5	P43026	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SELENOP	P49908	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PRODH	O43272	600 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	COL6A2	P12110	1019 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ACVRL1	P37023	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	EPHA5	P54756	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GPR85	P60893	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895		Q8N1X5	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895		Q8TCH9	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	DSE	Q9UL01	958 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CYR61	O00622	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KLF4	O43474	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	FZD7	O75084	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	LTF	P02788	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CSF2RB	P32927	897 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PFKP	Q01813	784 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	NTRK3	Q16288	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GML	Q99445	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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