RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.39■■□□□ 1.33
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C4orf48-201ENST00000409248 POTEBQ6S5H4 581 aa23.39■■□□□ 1.33
C4orf48-201ENST00000409248 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.39■■□□□ 1.33
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C4orf48-201ENST00000409248 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.36■■□□□ 1.33
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C4orf48-201ENST00000409248 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.32■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.32■■□□□ 1.32
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C4orf48-201ENST00000409248 LAD1O00515 517 aa23.31■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
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C4orf48-201ENST00000409248 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.3■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.3■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 MTMR9Q96QG7 549 aa23.3■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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C4orf48-201ENST00000409248 CLIC4Q9Y696 253 aa23.3■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 ZBBXA8MT70 800 aa23.29■■□□□ 1.32
C4orf48-201ENST00000409248 M0QZ92 97 aa23.29■■□□□ 1.32
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