RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 METTL7BQ6UX53 244 aa22.55■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.55■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.55■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.55■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.55■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF862O60290 1169 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 GUCY2CP25092 1073 aa22.54■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 ARID2Q68CP9 1835 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 TTI2Q6NXR4 508 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 P2RX5Q93086 422 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.54■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.54■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 DPP9Q86TI2 863 aa22.54■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF131P52739 623 aa22.53■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 CRHR2Q13324 411 aa22.53■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 ANO5Q75V66 913 aa22.53■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.53■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.53■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 SFR1Q86XK3 245 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 KATNBL1Q9H079 304 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 VTA1Q9NP79 307 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.52■■□□□ 1.2
HDDC3-202ENST00000394272 IFNKQ9P0W0 207 aa22.52■■□□□ 1.2
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HDDC3-202ENST00000394272 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.51■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 TMEM150BA6NC51 233 aa22.51■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 FAM13AO94988 1023 aa22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 PRKCEQ02156 737 aa22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 MAPK7Q13164 816 aa22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.5■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.5■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 PARVGQ9HBI0 331 aa22.5■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF302Q9NR11 478 aa22.5■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 GRM1Q13255 1194 aa22.49■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.49■■□□□ 1.19
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HDDC3-202ENST00000394272 PCYT2Q99447 389 aa22.49■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.49■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.49■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 RASSF10A6NK89 507 aa22.49■■□□□ 1.19
HDDC3-202ENST00000394272 SFI1A8K8P3 1242 aa22.49■■□□□ 1.19
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