RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 MBOAT7Q96N66 472 aa23.31■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 SIP14410 1827 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TRANK1O15050 2925 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TDP2O95551 362 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 PSAPP07602 524 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 FOSL2P15408 326 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP4AP20648 1035 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 MGAT3Q09327 533 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT8Q92599 483 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF2CQ99661 725 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.3■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR64B1ANS9 1081 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 CA3P07451 260 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 INF2Q27J81 1249 aa23.29■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 COL1A2P08123 1366 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TLL1O43897 1013 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 GAS7O60861 476 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD10O75832 226 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 GJB5O95377 273 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 OXER1Q8TDS5 423 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 APBB2Q92870 758 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 DISC1Q9NRI5 854 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMM50Q9Y512 469 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 EVPLQ92817 2033 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 SFNP31947 248 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ST3GAL1Q11201 340 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 GJA10Q969M2 543 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 JAK2O60674 1132 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 KLRC1P26715 233 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LPIN1Q14693 890 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LETM2Q2VYF4 491 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 IER5Q5VY09 327 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NEK8Q86SG6 692 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 AMHP03971 560 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 GHRP10912 638 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 JAK3P52333 1124 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TAP1Q03518 808 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NME8Q8N427 588 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 RDM1Q8NG50 284 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD9AQ99638 391 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 SQORQ9Y6N5 450 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 CHMP2AO43633 222 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC37A4O43826 429 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF15O94989 841 aa23.24■■□□□ 1.31
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UBE2E3-201ENST00000392415 KRT2P35908 639 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM167AQ96KS9 214 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LCHNA4D1U4 455 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF862O60290 1169 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NR5A1Q13285 461 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRE1Q14246 886 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFRSF25Q93038 417 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 M0QZ92 97 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP1P03956 469 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.22■■□□□ 1.31
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