RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 NR5A1Q13285 461 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 MYO9BQ13459 2157 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 BFSP2Q13515 415 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 MBTPS1Q14703 1052 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q4G0T1 1027 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 ABHD15Q6UXT9 468 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 WASF1Q92558 559 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC5A5Q92911 643 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 GJA10Q969M2 543 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 THEGQ9P2T0 379 aa13.09□□□□□ -0.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC37A4O43826 429 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MMP1P03956 469 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 SELPP16109 830 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 XBP1P17861 261 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPFIA1Q13136 1202 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PLCB4Q15147 1175 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TCTN1Q2MV58 587 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRT40Q6A162 431 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 CCDC155Q8N6L0 562 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 GLG1Q92896 1179 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATP6V0A1Q93050 837 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 STK24Q9Y6E0 443 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 NRCAMQ92823 1304 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.08□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 WNT7AO00755 349 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 NBNO60934 754 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATP4AP20648 1035 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RFC2P35250 354 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRT2P35908 639 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRT76Q01546 638 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RAB30Q15771 203 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 GRIK4Q16099 956 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 BACH2Q9BYV9 841 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 NCOR1O75376 2440 aa13.07□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 BTBD18B2RXH4 712 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PSMD10O75832 226 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 CXCL10P02778 98 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PFKMP08237 780 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MYOGP15173 224 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 STAT5BP51692 787 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RABGGTBP53611 331 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 NEK8Q86SG6 692 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RETREG2Q8NC44 543 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RIT2Q99578 217 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 AZI2Q9H6S1 392 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 MSRAQ9UJ68 235 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.06□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAS7O60861 476 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 FGBP02675 491 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 CTSHP09668 335 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 INSRRP14616 1297 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGFBP4P22692 258 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 THPOP40225 353 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 GUCY1B3Q02153 619 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 UGCGQ16739 394 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 LETM2Q2VYF4 491 aa13.05□□□□□ -0.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms