RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377047.8

GPC6-201, Transcript of glypican 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC6, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6-201ENST00000377047 HSPH1Q92598 858 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 DYDC2Q96IM9 177 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 TMEM260Q9NX78 707 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 CLGNO14967 610 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 KRT3P12035 628 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 ARHGAP4P98171 946 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 SLC35F6Q8N357 371 aa14.71□□□□□ -0.05
GPC6-201ENST00000377047 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 IQCB1Q15051 598 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ELP3Q9H9T3 547 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ATP1A2P50993 1020 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ZWILCHQ9H900 591 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.71□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CLTCL1P53675 1640 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 LRRD1A4D1F6 860 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 IKBKBO14920 756 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 MOCS3O95396 460 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RESTQ13127 1097 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ERICH1Q86X53 443 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SPATA33Q96N06 139 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ZNF394Q53GI3 561 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PADI6Q6TGC4 694 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TTC36A6NLP5 189 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ACAD9Q9H845 621 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 F5H6K3 240 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 FTCDO95954 541 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SERPING1P05155 500 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 KLRC3Q07444 240 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 MICALL2Q8IY33 904 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 FAM71BQ8TC56 605 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 KRT76Q01546 638 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 LRRC63Q05C16 580 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.7□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CASP2P42575 452 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RASSF2P50749 326 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ECEL1O95672 775 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 MMEL1Q495T6 779 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 POTEDQ86YR6 584 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SLC16A4O15374 487 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GNGT1P63211 74 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CDC25BP30305 580 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TSPY1Q01534 308 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RAET1EQ8TD07 263 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 NDST4Q9H3R1 872 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GPC3P51654 580 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GRM4Q14833 912 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SFR1Q86XK3 245 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CFAP36Q96G28 342 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 HUS1O60921 280 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PSMA2P25787 234 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ARHGAP25P42331 645 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 HMGCS2P54868 508 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 GPC4O75487 556 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 CXCR5P32302 372 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 ZNF699Q32M78 642 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 BEST2Q8NFU1 509 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 STAT3P40763 770 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC6-201ENST00000377047 KRT33BQ14525 404 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms