RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 ERO1AQ96HE7 468 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 HINFPQ9BQA5 517 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 PXMP2Q9NR77 195 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 HERVK_113P62684 666 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 BICD1Q96G01 975 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 NDST4Q9H3R1 872 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-201ENST00000368358 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 HUNKP57058 714 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CCL15Q16663 113 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 MTERF2Q49AM1 385 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SLC35F6Q8N357 371 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 NACC1Q96RE7 527 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 KIF20AO95235 890 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ABL1P00519 1130 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 OSBPP22059 807 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ERVK-24P63145 666 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 LENG9Q96B70 501 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CEP170P1Q96L14 293 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 K7ENM7 598 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 Q4G0T1 1027 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CTAGE9A4FU28 777 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 NR2F2P24468 414 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SOX10P56693 466 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 EFCC1Q9HA90 598 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 JADE2Q9NQC1 790 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 GINS2Q9Y248 185 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PIK3CDO00329 1044 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 STXBP2Q15833 593 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PADI6Q6TGC4 694 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 TMEM139Q8IV31 216 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 BTBD7Q9P203 1132 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 TBX3O15119 743 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CETN3O15182 167 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SLITRK3O94933 977 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 MYBP10242 640 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 APBA1Q02410 837 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 TRIM14Q14142 442 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SNAPC2Q13487 334 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PTPROQ16827 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 DPP9Q86TI2 863 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 NDUFA10O95299 355 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 IGBP1P78318 339 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 MAP3K10Q02779 954 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 VWA3BQ502W6 1294 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 GINM1Q9NU53 330 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PEX3P56589 373 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SPAG5Q96R06 1193 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PARVGQ9HBI0 331 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PCNTO95613 3336 aa14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 SCLT1Q96NL6 688 aa14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 WDR64B1ANS9 1081 aa14.67□□□□□ -0.06
HCN3-201ENST00000368358 KCNA1Q09470 495 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms