RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRK-205ENST00000368213 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRK-205ENST00000368213 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRK-205ENST00000368213 CEP55Q53EZ4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRK-205ENST00000368213 ATP2A3Q93084 1043 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-205ENST00000368213 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 67.5
PTPRK-205ENST00000368213 MTA3Q9BTC8 594 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-205ENST00000368213 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-205ENST00000368213 TRIM17Q9Y577 477 aa11.63□□□□□ -0.55
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