RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 FAM205CA6NFA0 338 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ACRP10323 421 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ATP2B1P20020 1258 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 CALCRLQ16602 461 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 POTEDQ86YR6 584 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 COL1A2P08123 1366 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 RSPH10BP0C881 870 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TRAPPC10P48553 1259 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 EPHB4P54760 987 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF365Q70YC5 407 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 GJA10Q969M2 543 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.44■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 M0QZ92 97 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PDCP20941 246 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MCM7P33993 719 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PPP2R5CQ13362 524 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 HIC1Q14526 733 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM240Q5SV17 173 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.43■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ZBBXA8MT70 800 aa16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 OATP04181 439 aa16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 SYT1P21579 422 aa16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 ADAM17P78536 824 aa16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.42■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 CTSHP09668 335 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PTMSP20962 102 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TXKP42681 527 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PRKCEQ02156 737 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TTC38Q5R3I4 469 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 IER5Q5VY09 327 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 HERVK_113Q902F9 699 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 HAS1Q92839 578 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 VAV3Q9UKW4 847 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.41■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 STX6O43752 255 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 PSMC5P62195 406 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 RPAINQ86UA6 219 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 WNT8BQ93098 351 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 SCN5AQ14524 2016 aa16.4■□□□□ 0.22
BRMS1-201ENST00000359957 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 KIF28PB7ZC32 967 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 MAGEB2O15479 319 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 TRAK2O60296 914 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 EFCAB14O75071 495 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 BAIAP3O94812 1187 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 KLRC1P26715 233 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 TMOD1P28289 359 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 KCNJ6P48051 423 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 EPHA7Q15375 998 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 XKR3Q5GH77 459 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 NME8Q8N427 588 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 BANK1Q8NDB2 785 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 MTMR6Q9Y217 621 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 WDR81Q562E7 1941 aa16.39■□□□□ 0.21
BRMS1-201ENST00000359957 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms