RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPV1Q8NER1 839 aa30.59■■■□□ 2.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM167AQ96KS9 214 aa30.55■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP170P1Q96L14 293 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP4AP20648 1035 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 TYRO3Q06418 890 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIML1Q8N9V2 468 aa30.49■■■□□ 2.47
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