RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF536O15090 1300 aa26.36■■□□□ 1.81
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TRIM54-201ENST00000296098 MMS19Q96T76 1030 aa26.33■■□□□ 1.81
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TRIM54-201ENST00000296098 KCND2Q9NZV8 630 aa26.33■■□□□ 1.81
TRIM54-201ENST00000296098 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.33■■□□□ 1.81
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
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TRIM54-201ENST00000296098 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.31■■□□□ 1.8
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TRIM54-201ENST00000296098 GHRHRQ02643 423 aa26.29■■□□□ 1.8
TRIM54-201ENST00000296098 RASSF7Q02833 373 aa26.29■■□□□ 1.8
TRIM54-201ENST00000296098 NFIL3Q16649 462 aa26.29■■□□□ 1.8
TRIM54-201ENST00000296098 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.29■■□□□ 1.8
TRIM54-201ENST00000296098 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.29■■□□□ 1.8
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