RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 CETN3O15182 167 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM13AO94988 1023 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 GUCY2CP25092 1073 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 KLK7P49862 253 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 LCTP09848 1927 aa23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 LYPLA2O95372 231 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 MYBP10242 640 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK17Q00537 523 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAM9Q13443 819 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ERO1BQ86YB8 467 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CHP1Q99653 195 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB39O15060 712 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 MAFGO15525 162 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 BANK1Q8NDB2 785 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CHST13Q8NET6 341 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 GPRASP2Q96D09 838 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PARVGQ9HBI0 331 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE4BO95155 1302 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CXCL11O14625 94 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NR3C2P08235 984 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 TREML2Q5T2D2 321 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 GLTPD2A6NH11 291 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NR2F2P24468 414 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NFIL3Q16649 462 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 LBX2Q6XYB7 198 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRX1Q86UT6 975 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ELP3Q9H9T3 547 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 SCN4AP35499 1836 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCGO15287 622 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 STAM2O75886 525 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFA10O95299 355 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 GCNT3O95395 438 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PLS1Q14651 629 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 FIZ1Q96SL8 496 aa23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25-201ENST00000293861 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 SFNP31947 248 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 JAK3P52333 1124 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 GNG11P61952 73 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT76Q01546 638 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 MYCT1Q8N699 235 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 ASTN1O14525 1302 aa23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 IRF6O14896 467 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 RDM1Q8NG50 284 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNMA1Q12791 1236 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 OTUD5Q96G74 571 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO40Q9UH90 709 aa23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 UTRNP46939 3433 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 SFI1A8K8P3 1242 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 PPIL2Q13356 520 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 C4orf19Q8IY42 314 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 CDHR1Q96JP9 859 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR24Q96S15 920 aa23.68■■□□□ 1.38
SNRNP25-201ENST00000293861 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms