RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 EHD2Q9NZN4 543 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 MED14O60244 1454 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 CLTCL1P53675 1640 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 KRIT1O00522 736 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 STAG3L1P0CL83 205 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 RAD51Q06609 339 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 GRM4Q14833 912 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 PADI6Q6TGC4 694 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM20AQ96MK3 541 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 GINM1Q9NU53 330 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 YY1P25490 414 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA1Q5VX52 437 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 STXBP3O00186 592 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 LIFRP42702 1097 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ST8SIA6P61647 398 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM151AQ8WW52 585 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 IFT43Q96FT9 208 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ERO1AQ96HE7 468 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 GCNT4Q9P109 453 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 LAMC1P11047 1609 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF75DP51815 510 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 LDHDQ86WU2 507 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 EFHBQ8N7U6 833 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ACAP3Q96P50 834 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 USP28Q96RU2 1077 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 CAPN15O75808 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 APOEP02649 317 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ASPHQ12797 758 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 ERICH1Q86X53 443 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 CHST13Q8NET6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 CPP00450 1065 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 CTSHP09668 335 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 DYDC2Q96IM9 177 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 GSDMAQ96QA5 445 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 USP31Q70CQ4 1352 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 IFNAR1P17181 557 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 PMLP29590 882 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 CYP27A1Q02318 531 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 CYP21A2P08686 494 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 MESDQ14696 234 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 DGKDQ16760 1214 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 PSMB7Q99436 277 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS6KA5O75582 802 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 PASKQ96RG2 1323 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 BUB1O43683 1085 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 RILPQ96NA2 401 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 CEP152O94986 1710 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 IGSF3O75054 1194 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFRB-201ENST00000261799 CAMTA2O94983 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms