RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 POTEBQ6S5H4 581 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 FERMT3Q86UX7 667 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 SERINC5Q86VE9 423 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TXKP42681 527 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 CCL23P55773 120 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 IGBP1P78318 339 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 PTK7Q13308 1070 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TMEM199Q8N511 208 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 MTMR6Q9Y217 621 aa23.68■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 OR52Z1P0C646 297 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 PRKCEQ02156 737 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BANK1Q8NDB2 785 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 SCLYQ96I15 445 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 SIP14410 1827 aa23.67■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 EVPLQ92817 2033 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 PITPNM1O00562 1244 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 HBP1O60381 514 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 GNAT1P11488 350 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RBL2Q08999 1139 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RESTQ13127 1097 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 CAGE1Q8TC20 777 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.385e-7■■■■□ 24.9
COX5B-201ENST00000258424 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.66■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 POTEMA6NI47 508 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 STX6O43752 255 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 CSF2RAP15509 400 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BFSP2Q13515 415 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 EPHA7Q15375 998 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BRAPQ7Z569 592 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ARID2Q68CP9 1835 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TET1Q8NFU7 2136 aa23.65■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 STBD1O95210 358 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 OATP04181 439 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CKBP12277 381 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PTGDRQ13258 359 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 VWCEQ96DN2 955 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 COL1A2P08123 1366 aa23.64■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TMEM150BA6NC51 233 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 IQCF3P0C7M6 154 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TMEM240Q5SV17 173 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 DYDC2Q96IM9 177 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FAM167AQ96KS9 214 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 RGL1Q9NZL6 768 aa23.63■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 SELPP16109 830 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 THPOP40225 353 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TECP42680 631 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PSMC5P62195 406 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CYP4A11Q02928 519 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 RETREG2Q8NC44 543 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 LXNQ9BS40 222 aa23.62■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ACRP10323 421 aa23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 GPNMBQ14956 572 aa23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ZNF365Q70YC5 407 aa23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.61■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 C22orf31O95567 290 aa23.6■■□□□ 1.37
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