RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229268.12

USP5-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP5, Length 3,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5-201ENST00000229268 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 BACH1O14867 736 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 EPHX2P34913 555 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 LRRC63Q05C16 580 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 EHHADHQ08426 723 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 XKR9Q5GH70 373 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PANX2Q96RD6 677 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CEP350Q5VT06 3117 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 C19orf81C9J6K1 198 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DYNC1I1O14576 645 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CETN3O15182 167 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 HIP1RO75146 1068 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PGK2P07205 417 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DMTNQ08495 405 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 EPHA7Q15375 998 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PARVGQ9HBI0 331 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 JADE2Q9NQC1 790 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.76□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CCNE2O96020 404 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZBTB9Q96C00 473 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 USP20Q9Y2K6 914 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 RASSF10A6NK89 507 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ACTN1P12814 892 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 HOXD13P35453 343 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PDE4CQ08493 712 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 MAN2A1Q16706 1144 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CDCA5Q96FF9 252 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 BTBD7Q9P203 1132 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CCDC169A6NNP5 214 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 FANCGO15287 622 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TERF1P54274 439 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ACAD9Q9H845 621 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.75□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 NF2P35240 595 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DEF6Q9H4E7 631 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 K7ENM7 598 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PPP1R2P41236 205 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 RIT2Q99578 217 aa14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 AKAP3O75969 853 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CCND2P30279 289 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PEX3P56589 373 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CASQ1P31415 396 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 NEK11Q8NG66 645 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 VGLL3A8MV65 326 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 SLC16A4O15374 487 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KIF20AO95235 890 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 NR3C1P04150 777 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KCNH2Q12809 1159 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 WDR59Q6PJI9 974 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 KIAA1328Q86T90 577 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.72□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 LRRC53A6NM62 1247 aa14.72□□□□□ -0.05
USP5-201ENST00000229268 CYP2C8P10632 490 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms