RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ECEL1O95672 775 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PSMA2P25787 234 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L15C9J2P7 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L11C9JVI0 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L18D6R9N7 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L22D6RA61 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L19D6RCP7 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L20D6RJB6 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 GFPT2O94808 682 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 IL9RQ01113 521 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 USP17L24Q0WX57 530 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 TXNRD1Q16881 649 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF699Q32M78 642 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 EFHBQ8N7U6 833 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 HSPH1Q92598 858 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ELP3Q9H9T3 547 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 SCINQ9Y6U3 715 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ABCB11O95342 1321 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 FDX1P10109 184 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 DRC3Q9H069 523 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 STAT3P40763 770 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 GPC3P51654 580 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGDIAP52565 204 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 PROSER3Q2NL68 480 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 MUM1Q2TAK8 710 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 SDE2Q6IQ49 451 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 GIPC2Q8TF65 315 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 ULK4Q96C45 1275 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 CFAP36Q96G28 342 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 NEO1Q92859 1461 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.33□□□□□ -0.59
TRPS1-201ENST00000220888 IKBKBO14920 756 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MT-ND3P03897 115 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CENPKQ9BS16 269 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TEX12Q9BXU0 123 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZWILCHQ9H900 591 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MYL1P05976 194 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MX2P20592 715 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 OCRLQ01968 901 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 DESI2Q9BSY9 194 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 COG4Q9H9E3 785 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SP110Q9HB58 689 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SUN2Q9UH99 717 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 UPP2O95045 317 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ASMTLO95671 621 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CYP27A1Q02318 531 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 WHAMMQ8TF30 809 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 OGFRQ9NZT2 677 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ERBB3P21860 1342 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 COBLO75128 1261 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RCN2Q14257 317 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TOM1L1O75674 476 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SREBF2Q12772 1141 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms