RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccr1P51675 355 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Il1rapl1P59823 695 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Islr2Q5RKR3 745 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ifit1Q64282 463 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam214aQ69ZK7 1075 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 ScapQ6GQT6 1276 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dnajc19Q9CQV7 116 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TtpalQ9D3D0 343 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cdh23Q99PF4 3354 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Arhgef26D3YYY8 869 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 RenbpP82343 430 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppp2r5cQ60996 524 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adcy3Q8VHH7 1145 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lmbr1Q9JIT0 490 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rabep1O35551 862 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Clcn3P51791 818 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Wdr5P61965 334 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nfe2Q07279 373 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sept8Q8CHH9 429 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 GlyctkQ8QZY2 523 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adgrg3Q8R0T6 542 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cep57l1Q8VDS7 400 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Clstn3Q99JH7 956 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cnpy2Q9QXT0 182 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa28.53■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TrioQ0KL02 3102 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TdgP56581 421 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tarbp2P97473 365 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slc2a13Q3UHK1 637 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Carmil2Q3V3V9 1296 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kcnj11Q61743 390 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nemp2Q8CB65 421 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Znf445Q8R2V3 986 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pcdhb12Q91Y07 789 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 AacsQ9D2R0 672 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cntn6Q9JMB8 1028 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Barx2O08686 283 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Api5O35841 504 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 March9Q3TZ87 348 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tmem199Q5SYH2 208 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Drc7Q6V3W6 876 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Usp38Q8BW70 1042 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gpr25P0C5I1 358 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Irf3P70671 419 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Inppl1Q6P549 1257 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Arhgef19Q8BWA8 802 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pnma1Q8C1C8 353 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nod2Q8K3Z0 1020 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atg13Q91YI1 516 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 FcrlaQ920A9 352 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adam33Q923W9 797 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mageb3Q9D2H4 330 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 GdaQ9R111 454 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Psmc5P62196 406 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Echdc2Q3TLP5 296 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rsph3aQ3UFY4 516 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zbtb5Q7TQG0 670 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slc2a12Q8BFW9 622 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Wdr11Q8K1X1 1223 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eml3Q8VC03 897 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rsph3bQ9DA80 389 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 DgkhD3YXJ0 1156 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm3164L7N2B9 238 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm3264L7N2C5 238 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 EnamO55196 1274 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atp6v1dP57746 247 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 DSCC1Q14AI0 399 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mettl14Q3UIK4 456 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Epha7Q61772 998 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Celf4Q7TSY6 486 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 F13a1Q8BH61 732 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Prrg2Q8R182 198 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sucla2Q9Z2I9 463 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cyp26c1B2RXA7 518 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Capn2O08529 700 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 U2af2P26369 475 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 CgnP59242 1191 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 C87499Q3UX49 493 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tgoln2Q62314 363 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PtprcapQ64697 197 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pus10Q9D3U0 527 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zfr2E9Q5M4 874 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Svs3aF2Z472 265 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kdelc2G5E897 503 aa28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17 ms