RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	RIM21	P48565	533 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PEX27	Q08580	376 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PET122	P10355	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	OAC1	P32332	324 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	SCO2	P38072	301 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	EXO84	P38261	753 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	NTA1	P40354	457 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MTO1	P53070	669 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MET2	P08465	486 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	TAT2	P38967	592 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	SDT1	P53078	280 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	TGL2	P54857	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	ROT1	Q03691	256 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	NDC1	P32500	655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	ZRT3	P34240	503 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	TAE1	P38340	232 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	AXL2	P38928	823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MBP1	P39678	833 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	AIM2	P39721	246 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	DIE2	P50076	525 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	FAP1	P53971	965 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	SPT14	P32363	452 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MED6	P38782	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YLR446W	Q06204	433 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	EAF1	Q06337	982 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YPL066W	Q12194	479 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MNN2	P38069	597 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	BIG1	P38813	335 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MDM31	P38880	579 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MOB1	P40484	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	MRH4	P53166	561 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	COA4	Q05809	96 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YPQ2	Q06328	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PUT4	YOR348C	YKR104W	P0CE69	306 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	CAP2	P13517	287 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	DBF2	P22204	572 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	TUL1	P36096	758 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YRO2	P38079	344 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	RRN10	P38204	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	RCY1	P39531	840 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	PRM10	P42946	383 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YMR087W	Q04299	284 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	RNH202	Q05635	350 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	PDR8	Q06149	701 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	SUL2	Q12325	893 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	SCM3	Q12334	223 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ARE1	P25628	610 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	CLG1	P35190	452 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	MRPL13	Q02204	264 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	FIN1	Q03898	291 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	PLP1	Q04004	230 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	REX4	Q08237	289 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	HSP42	Q12329	375 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YPR064W	Q12492	139 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	DMA1	P38823	416 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	MET30	P39014	640 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ZRG8	P40021	1076 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ROG1	P53118	685 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YPR196W	Q06595	470 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	STT4	P37297	1900 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	APT2	P36973	181 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	MAD2	P40958	196 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	YSA1	Q01976	231 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	RAM1	P22007	431 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	BUR6	P40096	142 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	NPY1	P53164	384 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	MKC7	P53379	596 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	ABZ2	Q03266	374 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	VPS68	Q12016	184 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	COQ8	P27697	501 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	NVJ1	P38881	321 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PUT4	YOR348C	QRI7	P43122	407 aa		13.36	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms