RNA–Protein interactions for RNA: YNL109W

YNL109W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL109W, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL109W	YNL109W	BNA5	Q05979	453 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	STE23	Q06010	1027 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BOP2	Q06150	570 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ARR1	Q06596	294 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	AYT1	Q12226	474 aa		3	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	GAL3	P13045	520 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YCR007C	P25354	239 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	GEX1	P25596	615 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	KRE6	P32486	720 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PMU1	P36069	295 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SWC5	P38326	303 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	TCD1	P38756	429 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YHR210C	P38893	341 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	AIM22	P47051	409 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BRO1	P48582	844 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YGL185C	P53100	379 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YGL108C	P53139	140 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MNT4	P53745	580 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SPO19	Q03029	223 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BCP1	Q06338	283 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BUG1	Q12191	341 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SRN2	Q99176	213 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RHO2	P06781	192 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PRB1	P09232	635 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	REV1	P12689	985 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RSR1	P13856	272 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ALG1	P16661	449 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	BEM1	P29366	551 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	AGA1	P32323	725 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SUA5	P32579	426 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
YNL109W	YNL109W	RPC37	P36121	282 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PCA1	P38360	1216 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MNL1	P38888	796 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	VPS52	P39904	641 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SHO1	P40073	367 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SCC4	P40090	624 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ALG8	P40351	577 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PIB2	P53191	635 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RTT102	P53330	157 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	IRC15	Q02733	499 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YDR541C	Q03049	344 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	CAB5	Q03941	241 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ERV41	Q04651	352 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	IPK1	Q06667	281 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YLL007C	Q07799	665 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MED4	Q12343	284 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RRD2	Q12461	358 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ARG80	P07249	177 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YCL068C	P25593	260 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	KRE2	P27809	442 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ECM25	P32525	599 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	UTR4	P32626	227 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	VHC1	P38329	1120 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	PET100	P38958	111 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ROG1	P53118	685 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	VOA1	P53262	265 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	MSC1	Q03104	513 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	SLD5	Q03406	294 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	IVY1	Q04934	453 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	RRG8	Q06109	277 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	ECM7	Q06200	448 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	VAC14	Q06708	880 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	YOR365C	Q08844	703 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YNL109W	YNL109W	COX3	P00420	269 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	COR1	P07256	457 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	RIP1	P08067	215 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	ATS1	P31386	333 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	SHP1	P34223	423 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	SIP3	P38717	1229 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YNL109W	YNL109W	YHR045W	P38775	560 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms