RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	PST1	Q12355	444 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BUD22	YMR014W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BUD22	YMR014W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BUD22	YMR014W	SNF8	Q12483	233 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BUD22	YMR014W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.65	□□□□□ -1.66
BUD22	YMR014W	UNG1	P12887	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CBS2	P14905	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CLN2	P20438	545 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	PEX1	P24004	1043 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	URK1	P27515	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	NTG1	P31378	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SSH4	P32343	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	NUP2	P32499	720 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SEC17	P32602	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	STE5	P32917	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	PMT1	P33775	817 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	TPO5	P36029	618 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	COS111	P38308	924 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MSS4	P38994	779 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	AVT6	P40074	448 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
BUD22	YMR014W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MET31	Q03081	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RCF1	Q03713	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GRX3	Q03835	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	FMP45	Q07651	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	PUT2	P07275	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YSR3	P23501	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ATP11	P32453	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	LOT5	P34234	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SOL2	P37262	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ARA1	P38115	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	INM1	P38710	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	APE4	P38821	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	IPT1	P38954	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GGC1	P38988	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SWD1	P39706	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SPO73	P40031	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	OSW5	P40219	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YJL055W	P47044	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YJL043W	P47053	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	BIR1	P47134	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	DAM1	P53267	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	VAC7	P53950	1165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	URC2	Q04411	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	TMN2	Q04562	672 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	APC4	Q04601	652 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ARR1	Q06596	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MDM36	Q06820	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GLE1	Q12315	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MET17	P06106	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	KAR1	P11927	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	TFS1	P14306	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ITR2	P30606	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	DCG1	P32460	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	ATG7	P38862	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RCY1	P39531	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	MPM1	P40364	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	AIM20	P40451	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	SDT1	P53078	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	CIK1	Q01649	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	GAD1	Q04792	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	REH1	Q06709	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RGT2	Q12300	763 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	YCL049C	P25577	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	HIR2	P32480	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD22	YMR014W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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