RNA–Protein interactions for RNA: YKL201C

MNN4, Transcript of Putative positive regulator of mannosylphosphate transferase Mnn6p, yeast

Gene MNN4, Length 3,537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNN4	YKL201C	GOS1	P38736	223 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	TRM5	P38793	499 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ATG7	P38862	630 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SHU2	P38957	223 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	QDR2	P40474	542 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HXT16	P47185	567 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	EXG2	P52911	562 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HXT15	P54854	567 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ARR1	Q06596	294 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	THP1	Q08231	455 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	REX4	Q08237	289 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ENA1	P13587	1091 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ITR1	P30605	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RCK1	P38622	512 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YIL086C	P40503	102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HOC1	P47124	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	TEN1	Q07921	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SFC1	P33303	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SDH3	P33421	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	BNA4	P38169	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	PLB1	P39105	664 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MEP2	P41948	499 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	LCL3	P53153	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	FHN1	P53279	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GIM3	P53900	129 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	COG5	P53951	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SMA2	Q04658	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YFT2	Q06676	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MST1	P07236	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ATR1	P13090	542 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	TAF14	P35189	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ATG14	P38270	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	UBS1	P38290	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YEL068C	P39977	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	CAB2	P40506	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YNL140C	P53910	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HFD1	Q04458	532 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	BSC2	Q05611	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	VID22	Q05934	901 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	STP3	Q05937	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GPI11	Q06636	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MRL1	Q06815	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RUP1	Q12242	671 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RAD7	P06779	565 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	TYR1	P20049	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RER1	P25560	188 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MTH1	P35198	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	OAR1	P35731	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MRPL15	P36523	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	UME6	P39001	836 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MTW1	P39731	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	BIO3	P50277	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YGL235W	P53071	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	COS7	Q07788	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HUA2	Q12134	243 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SFM1	Q12314	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	PTP1	P25044	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	PET127	P32606	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MDJ1	P35191	511 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	MIA40	P36046	403 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YIL077C	P40508	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ZIM17	P42844	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	SWF1	Q04629	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ARE1	P25628	610 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YOR062C	P36025	268 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	CCZ1	P38273	704 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GIP2	P40036	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	GNP1	P48813	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	RHO4	Q00246	291 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MNN4	YKL201C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms