RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	MRPS18	P42847	217 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	APS3	P47064	194 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YJR098C	P47139	656 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ROM1	P53046	1155 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ERP6	P53198	216 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	FHN1	P53279	174 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RHO4	Q00246	291 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RSM10	Q03201	203 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YDR444W	Q04093	687 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOR365C	Q08844	703 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MMT2	Q08970	484 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	PIN2	Q12057	282 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOR214C	Q12282	236 aa		5	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ALG7	P07286	448 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MOD5	P07884	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	FAR1	P21268	830 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	AGP1	P25376	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	TDP1	P38319	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	LEU5	P38702	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	TRR2	P38816	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MTW1	P39731	289 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	VPS52	P39904	641 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ECM10	P39987	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	VRG4	P40107	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	BIT61	P47041	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	STE24	P47154	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	URC2	Q04411	772 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	GPI11	Q06636	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ASA1	Q06822	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	GUP2	Q08929	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	VIK1	Q12045	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	HSP42	Q12329	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ARG81	P05085	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MER1	P16523	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	STE4	P18851	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	APN1	P22936	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MEF1	P25039	761 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ORC2	P32833	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MRPL6	P32904	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	AST1	P35183	429 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	BET3	P36149	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	FAU1	P40099	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	SNL1	P40548	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	SNM1	P40993	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YGR266W	P53326	701 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	REC102	Q02721	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RIM13	Q03792	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ARO10	Q06408	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RSA1	Q08932	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	APC2	Q12440	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YOS9	Q99220	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RIB3	Q99258	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ATR1	P13090	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	CBS1	P14066	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	KSS1	P14681	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	GRR1	P24814	1151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	POL4	P25615	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	PEP12	P32854	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	PEX6	P33760	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	NUF2	P33895	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MDJ1	P35191	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	VPS51	P36116	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	CFD1	P40558	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	FAR7	P43592	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	IDS2	P46958	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	RPA14	P50106	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	TWF1	P53250	332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YAT1	P80235	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	ARR1	Q06596	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SCW4	YGR279C	MCA1	Q08601	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	HNT3	Q08702	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SCW4	YGR279C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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