RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617346.4

RPL17-222, Transcript of ribosomal protein L17, human

TSL 5

Gene RPL17, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-222	ENST00000617346	NRCAM	Q92823	1304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346		E7EWF7	191 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	MMP1	P03956	469 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CD52	P31358	61 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	NEDD9	Q14511	834 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	APBB2	Q92870	758 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	IGFLR1	Q9H665	355 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	MGEA5	O60502	916 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	EYA4	O95677	639 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	RB1	P06400	928 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CHML	P26374	656 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	GRIK4	Q16099	956 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	UBE2S	Q16763	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	STAM2	O75886	525 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	INSRR	P14616	1297 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	RXRA	P19793	462 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	AR	P10275	920 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TCF15	Q12870	199 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	WTAP	Q15007	396 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	EDA	Q92838	391 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CDH22	Q9UJ99	828 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	STXBP3	O00186	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	HIP1	O00291	1037 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SGSM2	O43147	1006 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	GNAT1	P11488	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	IGBP1	P78318	339 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	KCNC3	Q14003	757 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	P2RX5	Q93086	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CD207	Q9UJ71	328 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	PER2	O15055	1255 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	CCNE2	O96020	404 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ATP4A	P20648	1035 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ERVFC1	P60507	584 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	FUT2	Q10981	343 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	COASY	Q13057	564 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	SUSD6	Q92537	303 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RPL17-222	ENST00000617346	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.9	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms