RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 STAM2O75886 525 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 RSPH10BP0C881 870 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCNA2P16389 499 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCTD2Q14681 263 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 PORCNQ9H237 461 aa21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CCNE1P24864 410 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KRT76Q01546 638 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TTI2Q6NXR4 508 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 EFCC1Q9HA90 598 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 BICDL2A1A5D9 508 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 WDR64B1ANS9 1081 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MUTP22033 750 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 COPB2P35606 906 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 PPP1R2P41236 205 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 JAK3P52333 1124 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 UGCGQ16739 394 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CDHR1Q96JP9 859 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 INTS13Q9NVM9 706 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.56■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SFI1A8K8P3 1242 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SFR1Q86XK3 245 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MROH8Q9H579 483 aa21.55■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCNJ18B7U540 433 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TPM3P06753 285 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SFNP31947 248 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCNJ12Q14500 433 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ARID5BQ14865 1188 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 WDR81Q562E7 1941 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM150BA6NC51 233 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SP2Q02086 613 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 PTPN18Q99952 460 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.54■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 LRMPQ12912 555 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 KRT31Q15323 416 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.53■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MCM3APO60318 1980 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 FAM13AO94988 1023 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CENPPQ6IPU0 288 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 VPS16Q9H269 839 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 MYH11P35749 1972 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.52■■□□□ 1.04
SYTL1-210ENST00000616558 EDNRBP24530 442 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 CASP5P51878 434 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 PSMC5P62195 406 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 CCNA1P78396 465 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 VSTM4Q8IW00 320 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 FGD4Q96M96 766 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 THAP9Q9H5L6 903 aa21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
SYTL1-210ENST00000616558 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms