RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KLRC4	O43908	158 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PLTP	P55058	493 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	C21orf2	O43822	256 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CASP4	P49662	377 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX1	Q13596	522 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB39	O15060	712 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	NR3C1	P04150	777 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PRPH	P41219	470 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	EPHB4	P54760	987 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MED24	O75448	989 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GNA14	O95837	355 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GCLM	P48507	274 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	IFT88	Q13099	833 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FGG	P02679	453 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DCC	P43146	1447 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMD14	O00487	310 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ATRN	O75882	1429 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP72	Q9P209	647 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ABCB11	O95342	1321 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	NDUFB10	O96000	172 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNA1	Q09470	495 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CTNNA2	P26232	953 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PTK2	Q05397	1052 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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