RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 POLR2MP0CAP2 368 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GNAT1P11488 350 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 RPS6KB1P23443 525 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 BMPR1AP36894 532 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 NDUFV1P49821 464 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GHRHRQ02643 423 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 HYAL1Q12794 435 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 CLUL1Q15846 466 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 RTN1Q16799 776 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 PXMP2Q9NR77 195 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ZXDAP98168 799 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 APOBRQ0VD83 1088 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 TCF15Q12870 199 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 BRF1Q92994 677 aa22.05■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 EYA4O95677 639 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 MMP1P03956 469 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 IER5LQ5T953 404 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA33Q96N06 139 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.04■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 TBX10O75333 385 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 NR3C2P08235 984 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.03■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 CACNA1HO95180 2353 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 FSD2A1L4K1 749 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 TGFB3P10600 412 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 CUL5Q93034 780 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 IGFLR1Q9H665 355 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.02■■□□□ 1.12
SGMS1-208ENST00000608287 GRM6O15303 877 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 HOXC8P31273 242 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 RCAN1P53805 252 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ADAM15Q13444 863 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 RUFY3Q7L099 469 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 P2RX5Q93086 422 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.01■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 LOC730098B7Z3J9 87 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 H3BRB1 525 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CDC27P30260 824 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 COASYQ13057 564 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PGM5Q15124 567 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 FBXL16Q8N461 479 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 SMRP1Q8NCR6 262 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 AGXT2Q9BYV1 514 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 MLXIPQ9HAP2 919 aa22■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 GGPS1O95749 300 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CTSHP09668 335 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CCND2P30279 289 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 IL31RAQ8NI17 732 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.111e-6■□□□□ 9.3
SGMS1-208ENST00000608287 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 FUT2Q10981 343 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 EFHBQ8N7U6 833 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 MEIS2O14770 477 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 TREHO43280 583 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PROB1E7EW31 1015 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 PIK3CDO00329 1044 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 AVPR2P30518 371 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 HIC1Q14526 733 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-208ENST00000608287 FAM26DQ5JW98 314 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms