RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 MTF1Q14872 753 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SYCP1Q15431 976 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC175P0C221 793 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 GAP43P17677 238 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 LXNQ9BS40 222 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 NDST4Q9H3R1 872 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 GNA14O95837 355 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RSPH10BP0C881 870 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MAP3K9P80192 1104 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SULF1Q8IWU6 871 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 DESI2Q9BSY9 194 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MYPNQ86TC9 1320 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ATP2A1O14983 1001 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CASP5P51878 434 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 VGLL4Q14135 290 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 IQCDQ96DY2 449 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 DNAJC7Q99615 494 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SYT17Q9BSW7 474 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 KCND2Q9NZV8 630 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 BANK1Q8NDB2 785 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ZBTB39O15060 712 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 FAM13AO94988 1023 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ERVK-24P63145 666 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 FIGNQ5HY92 759 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MYH11P35749 1972 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ADM5C9JUS6 153 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MYBP10242 640 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 KLK7P49862 253 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1W2PQJ5 194 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RASSF10A6NK89 507 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CCND2P30279 289 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 DLK2Q6UY11 383 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CSADQ9Y600 493 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ADAM9Q13443 819 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ACAD9Q9H845 621 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 SAMM50Q9Y512 469 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CETN3O15182 167 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 GCNT3O95395 438 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 ZBED6P86452 979 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MYCT1Q8N699 235 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-221ENST00000597512 MAF1Q9H063 256 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms