RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 SLC29A2Q14542 456 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 BLIDQ8IZY5 108 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 MTFR1LQ9H019 292 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 INTUQ9ULD6 942 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.79■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 F8VZ95 297 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 TNFRSF8P28908 595 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PRPHP41219 470 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 COPS2P61201 443 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 GBP5Q96PP8 586 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 GREM2Q9H772 168 aa16.78■□□□□ 0.28
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PDE4C-211ENST00000597360 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 NCALDP61601 193 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PKN1Q16512 942 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 SPATA5Q8NB90 893 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 RGPD5Q99666 1765 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ACSL3O95573 720 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 LINGO3P0C6S8 592 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 SV2BQ7L1I2 683 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 RASGRF2O14827 1237 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 CIAO1O76071 339 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 SERPING1P05155 500 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 PMS2P54278 862 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 BLMHQ13867 455 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 MIIPQ5JXC2 388 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 METTL13Q8N6R0 699 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 ANKS1AQ92625 1134 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4C-211ENST00000597360 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1W2PRG0 241 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF131P52739 623 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 RNF220Q5VTB9 566 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 RAB17Q9H0T7 212 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CUL3Q13618 768 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 RHOBTB3O94955 611 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CASP7P55210 303 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 KLC1Q07866 573 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 NAB2Q15742 525 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 TXNRD1Q16881 649 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 VPS36Q86VN1 386 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1B0GVG6 124 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM237Q96Q45 408 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 23.5
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PDE4C-211ENST00000597360 GSTA1P08263 222 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CALML3P27482 149 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 VPS41P49754 854 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 NBPF15Q8N660 670 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 SHISA4Q96DD7 197 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 FGD4Q96M96 766 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 TRIM9Q9C026 710 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 ADAMTS3O15072 1205 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CNGA1P29973 690 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 DR1Q01658 176 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 SEPT2Q15019 361 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4C-211ENST00000597360 CNBD1Q8NA66 436 aa16.75■□□□□ 0.27
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