RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IGBP1P78318 339 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01599Q8WXQ3 324 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM87BQ96K49 555 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PCYT2Q99447 389 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 JADE2Q9NQC1 790 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA6Q9UN73 950 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZP2Q05996 745 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TMTC2Q8N394 836 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC82Q8N4S0 544 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RWDD3Q9Y3V2 267 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEB3A0JP26 581 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEBQ6S5H4 581 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKIO75912 1065 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CSPG5O95196 566 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CALM1P0DP23 149 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CALM2P0DP24 149 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CALM3P0DP25 149 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ALADP13716 330 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 INSRRP14616 1297 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LIFRP42702 1097 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 HYAL1Q12794 435 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A2O14975 620 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CD52P31358 61 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM50BQ9Y247 325 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 NCK2O43639 380 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.292e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RRN3P2A6NIE6 340 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf67A6NJJ6 358 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFGO15525 162 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 DCXO43602 365 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP1P03956 469 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CLUL1Q15846 466 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ADHFE1Q8IWW8 467 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CRIPAKQ8N1N5 446 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCBQ8NB91 859 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM62Q0P6H9 643 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK1Q14012 370 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MICU3Q86XE3 530 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC6Q9Y210 931 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPV2Q9Y5S1 764 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX10O75333 385 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 IER5Q5VY09 327 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PGBD1Q96JS3 809 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 UIMC1Q96RL1 719 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PLVAPQ9BX97 442 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 AZI2Q9H6S1 392 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAGL2Q9UPG8 496 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01565O15544 149 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR2P61160 394 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCB4Q15147 1175 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 NECTIN1Q15223 517 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFLR1Q9H665 355 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SQORQ9Y6N5 450 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT6AQ92794 2004 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MBTPS2O43462 519 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ARP10275 920 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB1P25685 340 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IRS1P35568 1242 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NPAS4Q8IUM7 802 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.32■■■□□ 2.28
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