RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.59■□□□□ 0.25
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CTIF-205ENST00000587860 KRT86O43790 486 aa16.59■□□□□ 0.25
CTIF-205ENST00000587860 MYBP10242 640 aa16.59■□□□□ 0.25
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 KRT83P78385 493 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TPH2Q8IWU9 490 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 CCDC102AQ96A19 550 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 TSG101Q99816 390 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 AMNQ9BXJ7 453 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PLIN4Q96Q06 1357 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 MSH4O15457 936 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 BMP3P12645 472 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 RDH13Q8NBN7 331 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 EPS15P42566 896 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 EHHADHQ08426 723 aa16.55■□□□□ 0.24
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CTIF-205ENST00000587860 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 MYH4Q9Y623 1939 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 CCDC151A5D8V7 595 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 COG2Q14746 738 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 NUP58Q9BVL2 599 aa16.55■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PSMD14O00487 310 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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