RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584796.5

VAPA-208, Transcript of VAMP associated protein A, human

TSL 3

Gene VAPA, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAPA-208	ENST00000584796	LMF1	Q96S06	567 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VAPA-208	ENST00000584796	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VAPA-208	ENST00000584796	NES	P48681	1621 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VAPA-208	ENST00000584796	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VAPA-208	ENST00000584796	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	BLACE	A4D250	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	WNT9A	O14904	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	AMH	P03971	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	HMGA2	P52926	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RAB33A	Q14088	237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	CUTA	O60888	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	POLD1	P28340	1107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	USP51	Q70EK9	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	EDA	Q92838	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ADCY3	O60266	1144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PAK1	Q13153	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	AQP7	O14520	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RAD17	O75943	681 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	COMT	P21964	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ETV4	P43268	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RAC3	P60763	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	KLF10	Q13118	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	GPR19	Q15760	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ARVCF	O00192	962 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	AMY2A	P04746	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	AMY2B	P19961	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	CR2	P20023	1033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	GJA4	P35212	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	DUSP8	Q13202	625 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	FOXE3	Q13461	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	NFYC	Q13952	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	MATN2	O00339	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PDE6A	P16499	860 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAPA-208	ENST00000584796	PTGS1	P23219	599 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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