RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLC25A27O95847 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CD4P01730 458 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 THBS1P07996 1170 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FGFR3P22607 806 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 STAT3P40763 770 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCL23P55773 120 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GJA9P57773 515 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.653e-8■□□□□ 10.6
PTPRM-206ENST00000578093 ACVR2BQ13705 512 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 C12orf60Q5U649 245 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GPR152Q8TDT2 470 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CITED4Q96RK1 184 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 IL23AQ9NPF7 189 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ELP1O95163 1332 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ZBTB39O15060 712 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EFSO43281 561 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 B4GALT4O60513 344 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NDUFB10O96000 172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MX2P20592 715 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MAPK1P28482 360 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PSMC6P62333 389 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ARHGAP4P98171 946 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CNTN2Q02246 1040 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EHHADHQ08426 723 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 RAB30Q15771 203 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TMCO4Q5TGY1 634 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ARMCX2Q7L311 632 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CPXCR1Q8N123 301 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 HERVK_113Q902F9 699 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EDEM1Q92611 657 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM122AQ96E09 287 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SCLYQ96I15 445 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PNMA5Q96PV4 448 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 BCL11AQ9H165 835 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SH2D4AQ9H788 454 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CERS4Q9HA82 394 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MICAL3Q7RTP6 2002 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 F5H6K3 240 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 OPLAHO14841 1288 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NEFLP07196 543 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CA3P07451 260 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CYP2C9P11712 490 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 BMP4P12644 408 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SNAP25P60880 206 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 NKX3-2P78367 333 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 KLRC3Q07444 240 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCINQ13939 588 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TTLL4Q14679 1199 aa4.72□□□□□ -1.65
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