RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574218.1

CTNS-208, Transcript of cystinosin, lysosomal cystine transporter, human

TSL 5

Gene CTNS, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNS-208	ENST00000574218	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TLE6	Q9H808	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	HIP1	O00291	1037 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ITGB1	P05556	798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ADAM17	P78536	824 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FOXK2	Q01167	660 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MGAT3	Q09327	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TRDN	Q13061	729 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	GRIK4	Q16099	956 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	IER5	Q5VY09	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PIGS	Q96S52	555 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ERICH2	A1L162	156 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MARK3	P27448	753 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CD52	P31358	61 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	GLG1	Q92896	1179 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SCG2	P13521	617 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	DNAJB1	P25685	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	AVPR2	P30518	371 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	IGBP1	P78318	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PAK2	Q13177	524 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CAMK1	Q14012	370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	GRM4	Q14833	912 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	NUBP1	P53384	320 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	UBE3A	Q05086	875 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	EVPL	Q92817	2033 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	GLP2R	O95838	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	SEC23A	Q15436	765 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTNS-208	ENST00000574218	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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