RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	TRDN	Q13061	729 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	AAMP	Q13685	434 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	EDA	Q92838	391 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MEIS2	O14770	477 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ATP9A	O75110	1047 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJB1	P25685	340 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	WTAP	Q15007	396 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	GRIK4	Q16099	956 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ERICH2	A1L162	156 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	IGHD	P01880	384 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ITGB1	P05556	798 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CYP21A2	P08686	494 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	KCNA2	P16389	499 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFV1	P49821	464 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CUL5	Q93034	780 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CSPG5	O95196	566 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ITGB5	P18084	799 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MARK3	P27448	753 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CD52	P31358	61 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	COASY	Q13057	564 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169		M0R296	226 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	INSRR	P14616	1297 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	ANTXR2	P58335	489 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PTH1R	Q03431	593 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PKN1	Q16512	942 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	IER5	Q5VY09	327 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	GLG1	Q92896	1179 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PCYT2	Q99447	389 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169		E7EWF7	191 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	GLP2R	O95838	553 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	ZXDA	P98168	799 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	IER5L	Q5T953	404 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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