RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	SCLY	Q96I15	445 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.34	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	BACH1	O14867	736 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	CHMP2A	O43633	222 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP2B1	P20020	1258 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	FPGS	Q05932	587 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.33	■■□□□ 1.97
TPCN1-222	ENST00000552897	PTK7	Q13308	1070 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	INSRR	P14616	1297 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PPFIA1	Q13136	1202 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SHH	Q15465	462 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SNX21	Q969T3	373 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM20A	Q96MK3	541 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	27.31	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	EML1	O00423	815 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PSAP	P07602	524 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ACR	P10323	421 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	GRIK4	Q16099	956 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	UGCG	Q16739	394 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF3A	Q9Y496	699 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TBX3	O15119	743 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	RBL2	Q08999	1139 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	BFSP2	Q13515	415 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	GPNMB	Q14956	572 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TDH	Q8IZJ6	230 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.29	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF862	O60290	1169 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	CKB	P12277	381 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	IGBP1	P78318	339 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.28	■■□□□ 1.96	1e-6	■■■□□ 16.8
TPCN1-222	ENST00000552897	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MTMR9	Q96QG7	549 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.28	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	GNAT1	P11488	350 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SFN	P31947	248 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	MCM7	P33993	719 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC26A2	P50443	739 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	JAK3	P52333	1124 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP2R5C	Q13362	524 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	NBR1	Q14596	966 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF174	Q15697	407 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.27	■■□□□ 1.96	2e-6	■□□□□ 8.8
TPCN1-222	ENST00000552897	IL23A	Q9NPF7	189 aa		27.27	■■□□□ 1.96
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A1W2PPC1	479 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	NEMF	O60524	1076 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	CALCRL	Q16602	461 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	MCTP1	Q6DN14	999 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.26	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	KAT6A	Q92794	2004 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897		H3BQV1	296 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TPCN1-222	ENST00000552897	HBP1	O60381	514 aa		27.25	■■□□□ 1.95

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