RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 KLRC1P26715 233 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MBTPS1Q14703 1052 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ME3Q16798 604 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 LPPQ93052 612 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MSRAQ9UJ68 235 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 HES2Q9Y543 173 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MYH8P13535 1937 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 WNT7AO00755 349 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FGRP09769 529 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 STAT5BP51692 787 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 BCAR1P56945 870 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ACTR2P61160 394 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 OSTNP61366 133 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TMEM143Q96AN5 459 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TMEM87BQ96K49 555 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TBX21Q9UL17 535 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FGFR1P11362 822 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CLCN1P35523 988 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 OAZ1P54368 228 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SFI1A8K8P3 1242 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 B4DLN1 442 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CCNE2O96020 404 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 RUFY3Q7L099 469 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 HASPINQ8TF76 798 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ANKS1AQ92625 1134 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 BPTFQ12830 3046 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ATP2A1O14983 1001 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 GAS7O60861 476 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SPATA31D3P0C874 917 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SDF4Q9BRK5 362 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 POTEB3A0JP26 581 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 A6NJR5 290 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 HSPA4P34932 840 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 LAMC2Q13753 1193 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 UGCGQ16739 394 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CEP55Q53EZ4 464 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 POTEBQ6S5H4 581 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 NLRP7Q8WX94 980 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 POTEMA6NI47 508 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 KIF28PB7ZC32 967 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 STXBP3O00186 592 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PPFIA4O75335 1185 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 GRIK4Q16099 956 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 GPR20Q99678 358 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.52□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 C6orf50Q9HD87 102 aa8.52□□□□□ -1.04
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