RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF302Q9NR11 478 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 SETD4Q9NVD3 440 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 FAM205CA6NFA0 338 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 WDR64B1ANS9 1081 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 MARCH6O60337 910 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 PPFIA1Q13136 1202 aa24.81■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC37A4O43826 429 aa24.8■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 SFNP31947 248 aa24.8■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 HIC1Q14526 733 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.8■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 SCLYQ96I15 445 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 FAM20AQ96MK3 541 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 IL23AQ9NPF7 189 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 DISC1Q9NRI5 854 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 TRPC6Q9Y210 931 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 TBX3O15119 743 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 TREHO43280 583 aa24.79■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 RBL2Q08999 1139 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 PLCB4Q15147 1175 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 SHHQ15465 462 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 GRIK4Q16099 956 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 IQCF3P0C7M6 154 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 SELPP16109 830 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 EPHB4P54760 987 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 POTEBQ6S5H4 581 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 RDM1Q8NG50 284 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 GJA10Q969M2 543 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.78■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 CKBP12277 381 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRK-222ENST00000532751 INSRRP14616 1297 aa24.77■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.77■■□□□ 1.56
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PTPRK-222ENST00000532751 IGBP1P78318 339 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRK-222ENST00000532751 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 POTEDQ86YR6 584 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRK-222ENST00000532751 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 CAND2O75155 1236 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 FGBP02675 491 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 THPOP40225 353 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM240Q5SV17 173 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF365Q70YC5 407 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTPRK-222ENST00000532751 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 WNT8BQ93098 351 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTPRK-222ENST00000532751 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 H3BQV1 296 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 NEMFO60524 1076 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ATP2B1P20020 1258 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 CUL4AQ13619 759 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 FAM167AQ96KS9 214 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 COL1A2P08123 1366 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 PPP2R5CQ13362 524 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 CALCRLQ16602 461 aa24.73■■□□□ 1.55
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