RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 Q4G0T1 1027 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 DEFB123Q8N688 67 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TDP2O95551 362 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 STAT5BP51692 787 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PPFIA1Q13136 1202 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PLCB4Q15147 1175 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 GRIK4Q16099 956 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC5A5Q92911 643 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TNFRSF25Q93038 417 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 AZI2Q9H6S1 392 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CAND2O75155 1236 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 THPOP40225 353 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 INF2Q27J81 1249 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RIT2Q99578 217 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 INSRRP14616 1297 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC26A2P50443 739 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT76Q01546 638 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RABEP1Q15276 862 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TCTN1Q2MV58 587 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RPAINQ86UA6 219 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR81Q562E7 1941 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PSMD10O75832 226 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP4AP20648 1035 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 NR5A1Q13285 461 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 GJA10Q969M2 543 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.17e-10■□□□□ 8.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM205CA6NFA0 338 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC37A4O43826 429 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RSPH10BP0C881 870 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJB2P25686 324 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PBX2P40425 430 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM26DQ5JW98 314 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PBX4Q9BYU1 374 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 GBF1Q92538 1859 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 POTEB3A0JP26 581 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 BACH1O14867 736 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MMP1P03956 469 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ACTN1P12814 892 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT2P35908 639 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 POTEBQ6S5H4 581 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 NEK8Q86SG6 692 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF302Q9NR11 478 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 TRPC6Q9Y210 931 aa21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SLC43A3-217ENST00000530005 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 BAIAP3O94812 1187 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 LETM2Q2VYF4 491 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT40Q6A162 431 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PTPRSQ13332 1948 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SIP14410 1827 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZBBXA8MT70 800 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR64B1ANS9 1081 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 BTBD18B2RXH4 712 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms