RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 GRIK4Q16099 956 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT25Q7Z3Z0 450 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 UIMC1Q96RL1 719 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA6BQ9H3T3 888 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-217ENST00000527644 RRN3P2A6NIE6 340 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 DTNBO60941 627 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 BAIAP3O94812 1187 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM160B1Q5W0V3 765 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TET1Q8NFU7 2136 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 KIF2CQ99661 725 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PBX4Q9BYU1 374 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 CYP3A7P24462 503 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT76Q01546 638 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PLCB4Q15147 1175 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 Q4G0T1 1027 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TAF2Q6P1X5 1199 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM161BQ96MY7 647 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TRPC6Q9Y210 931 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 BACH1O14867 736 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MSH4O15457 936 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 INSRRP14616 1297 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MBTPS1Q14703 1052 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB30Q15771 203 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MOXD1Q6UVY6 613 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TIFAQ96CG3 184 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 GJB4Q9NTQ9 266 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MSRAQ9UJ68 235 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PBX2P40425 430 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MARCH8Q5T0T0 291 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RPAINQ86UA6 219 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RIT2Q99578 217 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF302Q9NR11 478 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 POTEB3A0JP26 581 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 INF2Q27J81 1249 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 SWSAP1Q6NVH7 229 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 POTEBQ6S5H4 581 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC5A5Q92911 643 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 MBOAT7Q96N66 472 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC9A7Q96T83 725 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 TDP2O95551 362 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PSAPP07602 524 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 IGBP1P78318 339 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 ST3GAL1Q11201 340 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM26DQ5JW98 314 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 PDXDC2PQ6P474 469 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RUFY4Q6ZNE9 571 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 RSPH3Q86UC2 560 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 GUCD1Q96NT3 240 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN4-217ENST00000527644 JAK2O60674 1132 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 CTSHP09668 335 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 OXER1Q8TDS5 423 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP8B4Q8TF62 1192 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 BRMS1Q9HCU9 246 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 WDR64B1ANS9 1081 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 HBP1O60381 514 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 GAS7O60861 476 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 EFCAB14O75071 495 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNJ6P48051 423 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 IKBKEQ14164 716 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 LRCH2Q5VUJ6 765 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF576Q9H609 170 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 SAMM50Q9Y512 469 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT2P35908 639 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 LETM2Q2VYF4 491 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 NEK8Q86SG6 692 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 SFNP31947 248 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 RABGGTBP53611 331 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 WDR5P61964 334 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM29Q14134 588 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 RABEP1Q15276 862 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 TCTN1Q2MV58 587 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-217ENST00000527644 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms