RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MAFGO15525 162 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 DGKIO75912 1065 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 IRS1P35568 1242 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MTMR1Q13613 665 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 TMTC2Q8N394 836 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MTA3Q9BTC8 594 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 C5orf42Q9H799 3197 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MBTPS2O43462 519 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CLUL1Q15846 466 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 IER5Q5VY09 327 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CASC1Q6TDU7 716 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 IGFLR1Q9H665 355 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 JADE2Q9NQC1 790 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SQORQ9Y6N5 450 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PRC1O43663 620 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MMP1P03956 469 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 INSRRP14616 1297 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CD52P31358 61 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 IGBP1P78318 339 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 ADAM15Q13444 863 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CAMK1Q14012 370 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 P2RX5Q93086 422 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 KCNH6Q9H252 994 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 WDFY4Q6ZS81 3184 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC69A6NI79 296 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 UBE2SQ16763 222 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PCYT2Q99447 389 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PCDHA6Q9UN73 950 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-210ENST00000527027 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.46■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 KAT6AQ92794 2004 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CSPG5O95196 566 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CALM1P0DP23 149 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CALM2P0DP24 149 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CALM3P0DP25 149 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 MCM5P33992 734 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM87BQ96K49 555 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 AZI2Q9H6S1 392 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CD207Q9UJ71 328 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PADI3Q9ULW8 664 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TTC3P53804 2025 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 M0QZ92 97 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01565O15544 149 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TBX10O75333 385 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 ITGB1P05556 798 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 STAG3L1P0CL83 205 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 RXRAP19793 462 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 FBXL18Q96ME1 805 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 SLC9A2Q9UBY0 812 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 STXBP3O00186 592 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 DNAJB1P25685 340 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 LIFRP42702 1097 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-210ENST00000527027 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms