RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 HMGCRP04035 888 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PDE6AP16499 860 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNAB2Q13303 367 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRR16Q569H4 304 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LY6G5CQ5SRR4 150 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 IQCEQ6IPM2 695 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNV1Q6PIU1 500 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TRIM48Q8IWZ4 208 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPR135Q8IZ08 494 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ANKRD35Q8N283 1001 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 NPLOC4Q8TAT6 608 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 DIO2Q92813 273 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 NELL1Q92832 810 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM161BQ96MY7 647 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FERD3LQ96RJ6 166 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRDM13Q9H4Q3 707 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ESYT3A0FGR9 886 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF839A8K0R7 811 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 KRIT1O00522 736 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC24A1O60721 1099 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPFIA4O75335 1185 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNH1O95259 989 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 IL18BPO95998 194 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 C1RP00736 705 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAN2A2P49641 1150 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCNN1GP51170 649 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PFKPQ01813 784 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 GRIN1Q05586 938 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 GNPTABQ3T906 1256 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CD276Q5ZPR3 534 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q6ZRM9 215 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 USP30Q70CQ3 517 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 BEND2Q8NDZ0 799 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FRS2Q8WU20 508 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MPHOSPH9Q99550 1183 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 RSAD1Q9HA92 442 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 VTI1BQ9UEU0 232 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC26A4O43511 780 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SORBS3O60504 671 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM20BO75063 409 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZFPL1O95159 310 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAHP16930 419 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBXO42Q6P3S6 717 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 POMZP3Q6PJE2 187 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC103Q8IW40 242 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF276Q8N554 614 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SHCBP1Q8NEM2 672 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHAMP1Q96JM3 812 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 NT5C1AQ9BXI3 368 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MRS2Q9HD23 443 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLDND1Q9NY35 253 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 AKT3Q9Y243 479 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC12A7Q9Y666 1083 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ITGB1P05556 798 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC7A5Q01650 507 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 LSAMPQ13449 338 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 RUFY4Q6ZNE9 571 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 MIEF2Q96C03 454 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR10A2Q9H208 303 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 C1orf115Q9H7X2 142 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 APEX2Q9UBZ4 518 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 EMC9Q9Y3B6 208 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC27A2O14975 620 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNQ1P51787 676 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 FOXF2Q12947 444 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 RIN1Q13671 783 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 WDR72Q3MJ13 1102 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 RABL3Q5HYI8 236 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 NBPF6Q5VWK0 638 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBXW10Q5XX13 1052 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q6YL49 198 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 RCBTB1Q8NDN9 531 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR14K1Q8NGZ2 314 aa2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms