RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KRIT1	O00522	736 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	WNT9A	O14904	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	FOXS1	O43638	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	LTF	P02788	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753		Q6ZUG5	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	AQP7	O14520	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MAFK	O60675	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	FBXO21	O94952	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	COL6A2	P12110	1019 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	NAT1	P18440	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GRK2	P25098	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GRK3	P35626	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GABRE	P78334	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	LMF1	Q96S06	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CDC6	Q99741	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KCNQ2	O43526	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	KNG1	P01042	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	TUSC3	Q13454	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ARVCF	O00192	962 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	EFCAB14	O75071	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	CSF2RB	P32927	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	PFKP	Q01813	784 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	FHL2	Q14192	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	BLACE	A4D250	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	IL18BP	O95998	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	SOD2	P04179	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	FAH	P16930	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	FOXE3	Q13461	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HERC4-215	ENST00000515753	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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