RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	MAN2A1	Q16706	1144 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TXNRD1	Q16881	649 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	INF2	Q27J81	1249 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C12orf60	Q5U649	245 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CNPY4	Q8N129	248 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA5	Q96PV4	448 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR9	Q96QG7	549 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP89	Q96ST8	783 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NDST4	Q9H3R1	872 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCF2	Q9UG63	623 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GUL6	1792 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PHLPP1	O60346	1717 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH6	P13533	1939 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ESYT2	A0FGR8	921 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC53	A6NM62	1247 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746		H0YGN5	161 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CES2	O00748	559 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HSF2BP	O75031	334 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ERLIN2	O94905	339 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GLI1	P08151	1106 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KLRK1	P26718	216 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	INPP5B	P32019	993 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC1A4	P43007	532 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NOV	P48745	357 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LIG3	P49916	1009 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC7A5	Q01650	507 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC63	Q05C16	580 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE4C	Q08493	712 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PAK2	Q13177	524 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PDCL	Q13371	301 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ITPK1	Q13572	414 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA4	Q13772	614 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NAB2	Q15742	525 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PTGIS	Q16647	500 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EML3	Q32P44	896 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM153C	Q494X1	144 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IFT20	Q8IY31	132 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZIM3	Q96PE6	472 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLIN2	Q99541	437 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EPN3	Q9H201	632 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EHD2	Q9NZN4	543 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	STK17A	Q9UEE5	414 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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