RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514197.5

ANK3-223, Transcript of ankyrin 3, human

TSL 5

Gene ANK3, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANK3-223	ENST00000514197	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	COL4A1	P02462	1669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PRMT3	O60678	531 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ADCY5	O95622	1261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TCF3	P15923	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PFKFB1	P16118	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	HOXA5	P20719	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF165	P49910	485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	AOC3	Q16853	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	LAMB2	P55268	1798 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CYP26A1	O43174	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SMC2	O95347	1197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TTLL1	O95922	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	F13B	P05160	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	POLD1	P28340	1107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	GNA11	P29992	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	NAPA	P54920	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	NLRP12	P59046	1061 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TCP10	Q12799	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PTPA	Q15257	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ZNF174	Q15697	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ANK3-223	ENST00000514197	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms