RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC39A13Q96H72 371 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 TEKT5Q96M29 485 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 LMCD1Q9NZU5 365 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC27A2O14975 620 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM253P0C7T8 217 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BNIP3Q12983 259 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2H3Q13889 308 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 DOC2BQ14184 412 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ACAP2Q15057 778 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKS4BQ8N8V4 417 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TIFAQ96CG3 184 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf92Q96LL3 132 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 AIFM3Q96NN9 605 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ACAP3Q96P50 834 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ORAI2Q96SN7 254 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MSRAQ9UJ68 235 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 NUB1Q9Y5A7 615 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MAFKO60675 156 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 VCAM1P19320 739 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GJA4P35212 333 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 EPHA5P54756 1037 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 KIR3DS1Q14943 382 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 EPHA7Q15375 998 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRNA2Q15822 529 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC14A2Q15849 920 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 CATSPEREQ5SY80 951 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC51AQ86UW1 340 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP43Q8NFH3 380 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 LRGUKQ96M69 825 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SMOC1Q9H4F8 434 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ACSL6Q9UKU0 697 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TADA3O75528 432 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SDHAP31040 664 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A11P48066 632 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 FNTBP49356 437 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TUSC3Q13454 348 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MSMPQ1L6U9 139 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL7Q6ZT98 887 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 RIC8BQ9NVN3 520 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ASGR2P07307 311 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ZP2Q05996 745 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SMC5Q8IY18 1101 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 JADE3Q92613 823 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MYOTQ9UBF9 498 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 RASSF10A6NK89 507 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 NOTOA8MTQ0 251 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXP2O15409 715 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 NRDCO43847 1150 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TGFB1P01137 390 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKCAP17252 672 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ENPP1P22413 925 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRNEQ04844 493 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GBX1Q14549 363 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 ERC2O15083 957 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GLI4P10075 376 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM27P14373 513 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 HK2P52789 917 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 MOGSQ13724 837 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM3Q14832 879 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 BRD3Q15059 726 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-205ENST00000514178 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms