RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 FERMT3Q86UX7 667 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 USP40Q9NVE5 1235 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 NESP48681 1621 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 CHGBP05060 677 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF28P17035 718 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 FANCLQ9NW38 375 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 NCANO14594 1321 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF839A8K0R7 811 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 SDSP20132 328 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 HERVK_113P62684 666 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM177Q53S58 311 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 MCTP2Q6DN12 878 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 CXorf38Q8TB03 319 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 DLG3Q92796 817 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 TEPSINQ96N21 525 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 CROTQ9UKG9 612 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-220ENST00000512069 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SLC12A8A0AV02 714 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 C9orf118A6NHY6 69 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 OPA1O60313 960 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SYN1P17600 705 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SEC23AQ15436 765 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 TLDC2A0PJX2 215 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KCNK3O14649 394 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 COL6A1P12109 1028 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 FLT3P36888 993 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 GJA9P57773 515 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 RGL3Q3MIN7 710 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 UBXN11Q5T124 520 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 PHF19Q5T6S3 580 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 NINJ1Q92982 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 TBX22Q9Y458 520 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SMARCA2P51531 1590 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 MROH6A6NGR9 719 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 TRAF5O00463 557 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SCDO00767 359 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ENPP3O14638 875 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 CDC45O75419 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KNG1P01042 644 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 CNR2P34972 360 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 TKFCQ3LXA3 575 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 WNK4Q96J92 1243 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 BDH2Q9BUT1 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 KCND1Q9NSA2 647 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 BTBD7Q9P203 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 NCAPD3P42695 1498 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 M0R2C6 588 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 FBXO21O94952 628 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-220ENST00000512069 IL18BPO95998 194 aa6.68□□□□□ -1.34
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