RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 PDCD1Q15116 288 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SEC14L1Q92503 715 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PALD1Q9ULE6 856 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RBP3P10745 1247 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 GRIN1Q05586 938 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 NETO2Q8NC67 525 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MYLIPQ8WY64 445 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SHISA4Q96DD7 197 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MKS1Q9NXB0 559 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 KIF3BO15066 747 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 KDM1AO60341 852 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CFBP00751 764 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TMEM253P0C7T8 217 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PNLIPP16233 465 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ATF3P18847 181 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CD40P25942 277 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 GJA4P35212 333 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 GPR3P46089 330 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CD97P48960 835 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PLCL1Q15111 1095 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 C16orf92Q96LL3 132 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA12O60330 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 DBHP09172 617 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ARL4AP40617 200 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ODF1Q14990 250 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 LILRA2Q8N149 483 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TTC8Q8TAM2 541 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MSRAQ9UJ68 235 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RASSF10A6NK89 507 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 F8W031 263 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ACOT7O00154 380 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 FOXP2O15409 715 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RFPL1O75677 317 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RAC2P15153 192 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SDHAP31040 664 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SNX17Q15036 470 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MLC1Q15049 377 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 EPHA7Q15375 998 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CLUL1Q15846 466 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 RELTQ969Z4 430 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PEX11GQ96HA9 241 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 CYBBP04839 570 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 MMEP08473 750 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 SDHBP21912 280 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 FNTBP49356 437 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 TCIRG1Q13488 830 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 NXNQ6DKJ4 435 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB6-210ENST00000498478 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms