RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESYT3A0FGR9 886 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC66A2RUB6 948 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE6AP16499 860 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.83□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.83□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAN2B1O00754 1011 aa6.82□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JAM2P57087 298 aa6.82□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.82□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.82□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP35Q9P2H5 1018 aa6.82□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.81□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASMTLO95671 621 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST5P78524 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRY1Q16526 586 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LGI4Q8N135 537 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MENTQ9BUN1 341 aa6.79□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC23AQ15436 765 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD276Q5ZPR3 534 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOMER1Q86YM7 354 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.78□□□□□ -1.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD6Q96DN6 1003 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRIQ9BWK5 157 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FANCLQ9NW38 375 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST13Q8NET6 341 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNERQ8NFT8 737 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIC6Q96NY7 704 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF747Q9BV97 191 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR42O15529 346 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASLP04424 464 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF28P17035 718 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PFKPQ01813 784 aa6.76□□□□□ -1.33
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